Intel编译器编译Madagascar

为了进一步提高程序的执行效率，在已安装Intel编译器的机器上，选择采用其编译器来编译madagascar的源码。

由于Madagascar的源码的Sconstruct文件对Intel编译部分不够完善，安装过程中会出现一些问题，稍微注意一下报错的信息，即可完成其安装。下面是安装的详细信息。

第一步安装时最好不要把安装位置放在需要root权限的目录下，放在自己的home下即可。

Configure

$ ./configure API=c++,f90 --prefix=/home/nick/software/rsf2.0 CC=/opt/intel/bin/icc  CXX=/opt/intel/bin/icpc FORTRAN=/opt/intel/bin/ifort  F90=/opt/intel/bin/ifort  LIBPATH=/opt/intel/lib/intel64

Compile

$ make

Attention

编译f90的时候可能出现一些小bug，比如没有生成mod文件之类的，目前我的解决方案是自己手动先编译出一个mod文件，然后再执行make.
还会遇到一些其他的问题，一般出现在user目录下，解决方案很简单，直接删除该目录即可，除了几个特别重要的目录，其他目录均可以删除，并不影响使用。

Install

$ make install